Warning: count(): Parameter must be an array or an object that implements Countable in /homepages/19/d650279470/htdocs/app653499953/wp-includes/post-template.php on line 284

Warning: count(): Parameter must be an array or an object that implements Countable in /homepages/19/d650279470/htdocs/app653499953/wp-includes/post-template.php on line 284

Warning: count(): Parameter must be an array or an object that implements Countable in /homepages/19/d650279470/htdocs/app653499953/wp-includes/post-template.php on line 284

Warning: count(): Parameter must be an array or an object that implements Countable in /homepages/19/d650279470/htdocs/app653499953/wp-includes/post-template.php on line 284

প্রোটিনের গঠন

প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞান (Protein Structural Biology)

 কোর্স পাতার শর্টলিংক

কোর্সের বর্ণনা:

সকল জীবদেহের জন্যই অপরিহার্য এক ধরণের জৈবিক অণু হল প্রোটিন। জীবকোষের প্রায় সব জৈবিক কাজেই প্রোটিন জরুরী। বিভিন্ন ধরনের প্রোটিন জীবদেহের অনুঘটন (জৈব-রাসায়নিক বিক্রিয়ায়), প্রয়োজনীয় মৌল (যেমন অক্সিজেন) বা যৌগ পরিবহন, চলন বা নড়াচড়ায় সহযোগিতা, এমনকি রোগপ্রতিরোধক হিসেবেও কাজ করে। প্রোটিন ছাড়া জীবের অস্তিত্ব কল্পনাই করা যায়না। কিন্তু মজার বিষয় হচ্ছে, প্রোটিনের সব ধরণের কাজই এর গঠনের সাথে সম্পৃক্ত। একটি প্রোটিন অণু বিভিন্ন ধরনের আকার যেমন নিতে পারে, তেমনি অন্য অণুর সঙ্গে মিলে বৃহদাকার কোন জৈবিক মেশিনও তৈরি করতে পারে। সহজ কথায় বলতে গেলে, প্রোটিন অণু কোন কাজ করবে কি করবেনা (সক্ষম বা অক্ষম) তা পুরোটাই নির্ভর করতে পারে এর গঠনের পরিবর্তনের উপর। গঠনের অল্প একটু পরিবর্তন তৈরি করতে পারে সিস্টিক ফিব্রোসিস বা আলঝাইমার্সের মত মারাত্মক অসুখ। তাই প্রোটিনের গঠন জানা এবং এ সংক্রান্ত গবেষণা আধুনিকচিকিৎসা বিজ্ঞান গবেষণার একটি প্রধান শাখা হয়ে দাঁড়িয়েছে। কিন্তু যন্ত্রপাতি এবং উপাত্তের উচ্চমূলে্যর কারণে আমাদের দেশে প্রোটিনের গঠনের উপর গবেষণাকর্ম খুঁজে পাওয়া দুষ্কর। তবে কিছুটা আশার কথা হল আমরা ইন্টারনেট ব্যবহার করে ঘরে বসেই এ বিষয়ে কিছু কিছু কাজ শিখতে পারি। আর সেজন্য আমাদের প্রোটিনের গঠন সম্পর্কে কিছু প্রাথমিক জ্ঞান থাকা প্রয়োজন। সে লক্ষে্যই এই কোর্সের অবতারণা। প্রোটিন-বিজ্ঞান নিয়ে যারা আগ্রহী তাদের সকলের জন্য এই কোর্স উপকারী হতে পারে।

নিবন্ধনের লিংক

এখানে ক্লিক করে কোর্সে নিবন্ধন করুন।  

 

শিক্ষকের পরিচিতি

আমি টরন্টো বিশ্ববিদ্যালয়ের মলিকিউলার জেনেটিক্স এর একজন পিএইচডি ছাত্র। কাজ করছি ম্যালেরিয়া জীবাণুর একধরনের প্রোটিন নিয়ে। আমার কাজ মূলতঃ এক্স-রে ক্রিস্টালোগ্রাফির মাধ্যমে প্রোটিনের গঠন নির্ণয়, এর সঙ্গে ম্যালেরিয়া রোগের সম্পর্ক নির্ধারণ এবং ঔষধ তৈরিতে সহায়তা করা ইত্যাদি বিষয়ের উপর। স্নাতক এবং মাস্টাসর্ ডিগ্রী অজর্ন করেছি চট্টগ্রাম বিশ্ববিদ্যালয় থেকে অণুজীব বিজ্ঞান নিয়ে। আমার বতর্মান ল্যাব এর ওয়েবসাইটে ঢু মেরে দেখতে পারেন এখানে: www.thesgc.org

কোর্সটি কাদের জন্য:

প্রোটিন নিয়ে জানতে আগ্রহী সবার জন্য।

 

সময়কাল:

কোর্সটি শুরু হবে ১৫ সেপ্টেম্বর, ২০১২ থেকে। প্রতি সপ্তাহে অন্তত একটি করে ভিডিও আপলোড করা হবে।

 

কয়টি লেকচার:

৭ টি

 

সিলেবাস:

লেকচার ১

১. প্রাথমিক ধারণা (Introduction)

১.১ প্রোটিন: জীবনের চাবিকাঠি (Proteins play key roles in living systems)

১.২ জীবদেহে প্রোটিন এর কাজ (Function)

১.২.১ অনুঘটন (Catalysis)

১.২.২ পরিবহন (Transport)

১.২.৩ তথ্য স্থানান্তর (Information transfer)

১.৩ প্রোটিন সংশ্লেষণ: প্রাথমিক আলোচনা (Protein synthesis: basic)

১.৪ গঠন জানা কেন জরুরী (Why structure is important)

১.৫ প্রোটিন এবং মানবরোগ (Proteins and human diseases)

১.৫.১ ঔষধ উদ্ভাবনে প্রোটিন বিজ্ঞানের গুরুত্ব (Protein science in drug discovery)

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে 

 

লেকচার ২

২. প্রোটিনের গাঠনিক রসায়ন (Chemistry of protein structure)

২.১ এমিনো এসিড (Amino acid)

২.১.১ এমিনো এসিড পলিমার: প্রাথমিক গঠন (Polymer of amino acids: The primary structure)

২.১.২ জিন থেকে প্রোটিন (From gene to protein)

২.১.৩ এমিনো এসিড সন্নিবেশন (Assembly of amino acids)

২.১.৪ প্রোটিন ফোল্ডিং (Protein folding)

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে 

 

লেকচার ৩

২.২ মাধ্যমিক গঠন: প্রাথমিক গাঠনিক একক (Secondary structure)

২.২.১ হাইড্রোজেন বন্ডিং (Hydrogen Bonding)

২.২.২ আলফা হেলিক্স (Alpha helix)

২.২.৩ বেটা শিট (Beta sheet)

২.২.৪ কয়েল (Coil)

২.২.৫ রামাচন্দ্রনের প্লট (The Ramachandran plot)

২.২.৬ প্রোটিন প্যাকিং (Protein packing)

২.৩. তৃতীয় পযর্ায়ের গঠন (Tertiary structure)

২.৩.১ প্রোটিন ইন্টারেকশন (Protein interactions)

২.৪ চতুর্থ পযর্ায়ের গঠন (Quaternary structure)

 লেকচারটি দেখুন এখান থেকে  ১ম

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে  ২য়

 

লেকচার ৪

৩. প্রোটিনের গাঠনিক নিমর্াণরীতি (Structural architecture of proteins)

৩.১ মোটিফ (Motif)

৩.২ ফোল্ডিং এবং ডোমেইন (Folding and domains)

৩.৩ গাঠনিক শ্রেণীবিন্যাস: টপলজি, ফোল্ডিং-ফ্যামিলি, সুপার-ফ্যামিলি (Structural classification: Topology, Folding-family, Super-family)

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে  

 

লেকচার ৫

৪. প্রোটিনের গঠন বিশ্লেষণ ও নির্ধারণ পদ্ধতি (Structure determination and analysis)

৪.১ প্রোটিনের ভান্ডার: প্রোটিন ডাটা ব্যাংক (Repository of protein structures: Protein Data Bank)

৪.২ প্রোগ্রামের সঙ্গে প্রাথমিক পরিচয়: পাইমোল, কাইমেরা, মোলসফট (Introduction to the programs: PyMol, Chimera, Spdbv)

৪.২.১ পাইমোল: প্রাথমিক ব্যবহার প্রণালী (Basic user manual of PyMol)

৪.৩ গঠন নিধর্ারণ পদ্ধতি (Structure determination)

৪.৩.১ এক্স-রে ক্রিস্টালোগ্রাফি (X-ray crystallography)

৪.৩.২ এনএমআর স্পেক্ট্রোস্কোপি (NMR spectroscopy)

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে  ১ম

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে  ২য়

 

লেকচার ৬

৫. বায়োইনফরমেটিক বিশ্লেষণ (Bioinformatic analysis of protein structures)

৫.১ কিছু বিশ্লেষণী প্রোগ্রাম (র্Programs for analysis)

৫.১.১ CATH

৫.১.২ SCOP

৫.১.৩ FSSP

৫.২ গঠন অনুমান (Structure prediction)

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে

 

লেকচার ৭

৬. পরিশেষ (Conclusion)

৬.১ উদাহরণ: কিছু নোবেল বিজয়ী প্রোটিন-গঠন গবেষণা (Examples of Nobel-winning structures)

লেকচারটি দেখুন এখান থেকে 

Comments

comments

23 pings

Skip to comment form

  1. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ১- মৌলিক ধারণা - শিক্ষক - বাংলা ভাষায় অনলাইনে মুক্ত জ্ঞানের ম

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনআমাদের কথাশিক্ষক হতে […]

  2. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ২- গাঠনিক রসায়ন-প্রাথমিক গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষায় অনলাইনে

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  3. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  4. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  5. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  6. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  7. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  8. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  9. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  10. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞানঃ লেকচার ৩ক- গাঠনিক রসায়ন-দ্বিতীয় মাত্রার গঠন - শিক্ষক - বাংলা ভাষা

    […] কথা বলা (C++)বায়োইনফরমেটিক্স পরিচিতিপ্রোটিনের গঠনক্যান্সার ন্যানোটেকনলজিমেটাবলিক […]

  11. প্রোটিনের গাঠনিক জীববিজ্ঞান, লেকচার ৪: গাঠনিক নির্মাণরীতি - শিক্ষক - বাংলা ভাষায় অনলাইনে মুক্ত জ্

    […] by তানজীদ ওসমান পিডিএফ ফরম্যাটে সেইভ করুন [পূবর্ের লেকচার] [নিবন্ধন ফর্ম] [কোর্সের মূল পাতা] […]